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這一馬鈴薯育種和繁殖的新底層技術(shù),北京時間6月24日23時在線發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞(Cell)》,這是“優(yōu)薯計劃”實施以來取得的里程碑式突破。
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代二倍體馬鈴薯雜交種具有顯著的雜種優(yōu)勢。中國農(nóng)科院基因組所供圖
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據(jù)《雜交馬鈴薯的基因組設(shè)計》論文的作者,中國農(nóng)科院深圳基因組所研究員張春芝介紹,與谷物類糧食作物不同,普通栽培馬鈴薯是依靠薯塊進(jìn)行無性繁殖的同源四倍體物種,但由于四倍體遺傳的復(fù)雜性,致使馬鈴薯的遺傳改良進(jìn)程緩慢,一些上百年歷史的馬鈴薯品種仍然在廣泛種植。如美國的薯條加工型品種Russet Burbank,是1902年育成的,至今仍是美國的大品種。中國栽培面積大的品種“克新1號”是1958年育成的,至今已經(jīng)種植了60多年。
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目前,二倍體育種已經(jīng)成為全球馬鈴薯研究領(lǐng)域熱點,荷蘭、中國和美國等國科學(xué)家紛紛呼吁開展二倍體的研究和育種工作。但要實現(xiàn)二倍體雜交馬鈴薯育種,需克服兩個關(guān)鍵障礙:自交不親和與自交衰退。
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張春芝解釋,自交不親和是指植物自花授粉后不會產(chǎn)生種子的現(xiàn)象。要培育自交系,首先需要解決自交不親和問題。在前期研究中,黃三文團(tuán)隊通過基因組編輯技術(shù)敲除了控制馬鈴薯自交不親和的S-RNase基因,篩選到了S-RNase的天然突變體,并克隆了來自野生種的自交親和基因,徹底解決了自交不親和問題。
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“自交衰退則是指生物在自交之后出現(xiàn)生理機(jī)能的衰退,表現(xiàn)為生活力下降、抗性減弱、產(chǎn)量降低等”。張春芝表示,馬鈴薯作為異交作物,在長期的無性繁殖過程中,累積了大量的隱性有害突變,一旦自交之后,有害突變的不良效應(yīng)便會顯現(xiàn)出來,導(dǎo)致自交衰退。與自交不親和由少數(shù)幾個基因控制不同,自交衰退涉及很多基因,也更難克服。荷蘭科學(xué)家在2011年就公布了雜交馬鈴薯的進(jìn)展,但是10年之后仍然面臨自交系純度較低的問題,限制了大規(guī)模商業(yè)化推廣,“主要就是因為無法克服自交衰退的問題”。
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來源:論文插圖
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黃三文團(tuán)隊前期對馬鈴薯自交衰退的遺傳進(jìn)行了系統(tǒng)解析。研究發(fā)現(xiàn),導(dǎo)致自交衰退的有害突變鑲嵌分布在馬鈴薯的兩套基因組中,無法通過重組將它們徹底淘汰。但是,不同馬鈴薯中的有害突變具有個體差異性,可以通過對遺傳背景差異大的自交系進(jìn)行雜交來掩蓋雜交種中有害突變的效應(yīng)。這些研究表明,基于表型選擇的育種策略,難以克服自交衰退的問題,必須借助基因組大數(shù)據(jù)開展設(shè)計育種,才能有效地淘汰有害突變。
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在此基礎(chǔ)之上,黃三文團(tuán)隊?wèi){借基因組學(xué)研究方面的優(yōu)勢,利用基因組大數(shù)據(jù)進(jìn)行育種決策,建立了雜交馬鈴薯基因組設(shè)計育種“四步法”流程:
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步,用于培育自交系的起始的選擇,選擇標(biāo)準(zhǔn)是起始材料的基因組雜合度較低和有害突變數(shù)目較少;第二步,起始材料自交群體的遺傳解析,主要是根據(jù)全基因組偏分離分析和表型評價,確定大效應(yīng)有害等位基因和優(yōu)良等位基因在基因組中的分布;第三步,自交系的選育,根據(jù)前景和背景選擇淘汰大效應(yīng)的有害突變,并聚合優(yōu)良等位基因,尤其是要打破大效應(yīng)有害突變和優(yōu)良等位基因之間的連鎖;后一步,雜交種的選育,根據(jù)基因組測序的結(jié)果,選擇基因組互補(bǔ)性比較高的自交系進(jìn)行雜交,獲得雜種優(yōu)勢顯著的雜交種。通過“四步法”,該團(tuán)隊已經(jīng)培育出代高純合度(>99%)二倍體馬鈴薯自交系和雜交馬鈴薯品系“優(yōu)薯1號”。小區(qū)試驗顯示“優(yōu)薯1號”產(chǎn)量接近3噸/畝,具有顯著的產(chǎn)量雜種優(yōu)勢。同時,“優(yōu)薯1號”具有高干物質(zhì)含量和高類胡蘿卜素含量特點,蒸煮品質(zhì)佳。
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“優(yōu)薯1號”的成功選育證明了雜交馬鈴薯育種的可行性,使馬鈴薯遺傳改良進(jìn)入了快速迭代的軌道。2020年11月8日,已故“雜交水稻之父”袁隆平院士在聽取該項研究介紹之后,題詞評價:“馬鈴薯雜交種子繁殖技術(shù)是顛覆性創(chuàng)新,將帶來馬鈴薯的綠色革命”。